本校創立於民國64年8月，原為新竹縣立竹北國中鳳岡分部。68年奉准獨立設校名為鳳岡國民中學。首任校長為張久進先生，經其努力擘畫，奠定本校良好發展基礎。
70年至80年十年間，在連添財校長、鄭榮壽校長、陳鴻焜校長三位校長的帶領下，使本校面目一新，呈現一片欣欣向榮的朝氣；並完成全校排水設備、兩百公尺跑道、兩座籃球場及各種教學設備，包含龍團部、輔導室、音樂教室的藝能科大樓，使教學行政有更良好的校舍可供使用。
80年3月，李妙靜女士接任校長，以「培養守法好禮、文質彬彬的紳士淑女」為辦學目標，除了注重生活教育外，更積極美化校園，妥善規劃各專科教室、視聽教室，以發揮其境教功能。
83年9月，張美珍女士接任校長，其辦學理念為「以服務代替領導」，實現「學生第一、教學為先」的目標，並加強人文素養，激勵學生發揮潛能。
85年8月，陳梅芳校長銳意革新校務，全力發展學校特色，結合社區文化成立舞龍隊及棒球隊，期能營造更優質的教學環境。
87年8月，鄭飄先生接任校長，他秉持著「鳳岡是道場、教育是修行」的理念，特重品德、生活及禮儀教育，希望學生個個品德優良、知識豐富、儀容端正，做到行如風、立如松、臥如弓、坐如鐘，動靜有節。
92年9月，鄭飄校長榮調本縣教育局局長，校長一職由謝鳳香女士接任，謝校長秉持著「學校不在乎大小，而在乎能否發光發熱」，堅持給學生的一樣都不能少，力行「四不、一沒有、兩個願意、三個open」的教育信念。
99年8月，陳美君女士接任校長，除了傳承舊有的優良傳統之外，更致力推動學生發展以「多元智慧」為基礎，「完全學習」為歷程，以「全人發展」為理想，並推動「活化教學」，建立「學習共同體」，讓每一位學生在學習型社會中，確立寬廣多元之人生價值，充分實現自我，成就和諧社會。
105年8月，徐永明先生接任本校第十一任校長，在既有基礎上，配合教育政策與趨勢，打造一個愛與關懷的校園文化；任內不僅完成校內兩棟教學大樓的整建美化，更設置自造教育及科技中心，且爭取教育行動區計畫，將竹北西區五校串連，透過活化行政效能、老師專業教學、家長支持參與及學生開心學習，培育出充滿「活力、適性、創意、健康」的優質鳳中學子。